Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KLK3P07288 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLK3P07288 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLK3P07288 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLK3P07288 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLK3P07288 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLK3P07288 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLK3P07288 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLK3P07288 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLK3P07288 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLK3P07288 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLK3P07288 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLK3P07288 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLK3P07288 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLK3P07288 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLK3P07288 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLK3P07288 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLK3P07288 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KLK3P07288 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLK3P07288 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLK3P07288 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLK3P07288 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLK3P07288 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLK3P07288 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLK3P07288 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KLK3P07288 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLK3P07288 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLK3P07288 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLK3P07288 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLK3P07288 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLK3P07288 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLK3P07288 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLK3P07288 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLK3P07288 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLK3P07288 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLK3P07288 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLK3P07288 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLK3P07288 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLK3P07288 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KLK3P07288 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLK3P07288 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLK3P07288 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLK3P07288 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLK3P07288 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLK3P07288 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLK3P07288 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLK3P07288 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLK3P07288 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLK3P07288 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLK3P07288 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLK3P07288 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLK3P07288 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLK3P07288 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLK3P07288 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLK3P07288 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLK3P07288 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLK3P07288 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLK3P07288 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLK3P07288 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLK3P07288 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLK3P07288 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLK3P07288 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLK3P07288 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLK3P07288 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLK3P07288 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLK3P07288 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLK3P07288 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLK3P07288 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLK3P07288 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLK3P07288 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLK3P07288 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLK3P07288 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLK3P07288 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLK3P07288 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLK3P07288 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLK3P07288 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLK3P07288 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLK3P07288 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KLK3P07288 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLK3P07288 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLK3P07288 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLK3P07288 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLK3P07288 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLK3P07288 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLK3P07288 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KLK3P07288 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLK3P07288 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLK3P07288 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLK3P07288 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KLK3P07288 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLK3P07288 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLK3P07288 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLK3P07288 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLK3P07288 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLK3P07288 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLK3P07288 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLK3P07288 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLK3P07288 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLK3P07288 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLK3P07288 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms