Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPIND1P05546 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPIND1P05546 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERPIND1P05546 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms