Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-HP01893 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-HP01893 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-HP01893 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms