Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBC1P01850 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRBC1P01850 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBC1P01850 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms