Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SVILO95425 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SVILO95425 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SVILO95425 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SVILO95425 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SVILO95425 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SVILO95425 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SVILO95425 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SVILO95425 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SVILO95425 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SVILO95425 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SVILO95425 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SVILO95425 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SVILO95425 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SVILO95425 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SVILO95425 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SVILO95425 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SVILO95425 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SVILO95425 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SVILO95425 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SVILO95425 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SVILO95425 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SVILO95425 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SVILO95425 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SVILO95425 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SVILO95425 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SVILO95425 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SVILO95425 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVILO95425 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVILO95425 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVILO95425 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVILO95425 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVILO95425 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVILO95425 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVILO95425 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVILO95425 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVILO95425 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SVILO95425 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SVILO95425 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SVILO95425 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SVILO95425 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SVILO95425 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SVILO95425 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SVILO95425 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SVILO95425 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SVILO95425 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SVILO95425 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SVILO95425 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SVILO95425 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SVILO95425 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SVILO95425 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SVILO95425 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SVILO95425 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SVILO95425 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SVILO95425 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SVILO95425 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SVILO95425 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SVILO95425 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SVILO95425 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SVILO95425 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SVILO95425 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SVILO95425 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SVILO95425 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SVILO95425 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SVILO95425 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SVILO95425 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SVILO95425 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SVILO95425 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SVILO95425 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SVILO95425 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SVILO95425 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SVILO95425 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SVILO95425 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SVILO95425 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SVILO95425 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SVILO95425 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SVILO95425 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SVILO95425 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SVILO95425 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SVILO95425 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SVILO95425 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SVILO95425 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SVILO95425 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SVILO95425 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SVILO95425 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SVILO95425 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SVILO95425 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SVILO95425 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SVILO95425 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SVILO95425 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SVILO95425 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SVILO95425 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SVILO95425 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SVILO95425 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SVILO95425 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SVILO95425 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SVILO95425 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SVILO95425 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SVILO95425 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SVILO95425 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms