Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR47O94967 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR47O94967 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR47O94967 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR47O94967 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR47O94967 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR47O94967 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR47O94967 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR47O94967 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR47O94967 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR47O94967 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR47O94967 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR47O94967 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR47O94967 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR47O94967 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR47O94967 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR47O94967 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR47O94967 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR47O94967 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR47O94967 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR47O94967 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR47O94967 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR47O94967 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR47O94967 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR47O94967 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR47O94967 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR47O94967 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR47O94967 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR47O94967 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR47O94967 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR47O94967 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR47O94967 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR47O94967 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR47O94967 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR47O94967 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR47O94967 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR47O94967 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR47O94967 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR47O94967 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR47O94967 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR47O94967 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR47O94967 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR47O94967 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR47O94967 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR47O94967 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR47O94967 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR47O94967 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR47O94967 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR47O94967 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR47O94967 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR47O94967 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR47O94967 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR47O94967 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR47O94967 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR47O94967 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR47O94967 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR47O94967 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR47O94967 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR47O94967 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR47O94967 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR47O94967 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR47O94967 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR47O94967 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR47O94967 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR47O94967 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR47O94967 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR47O94967 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR47O94967 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR47O94967 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR47O94967 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR47O94967 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR47O94967 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR47O94967 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR47O94967 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR47O94967 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR47O94967 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR47O94967 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR47O94967 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR47O94967 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR47O94967 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR47O94967 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR47O94967 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR47O94967 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR47O94967 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR47O94967 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR47O94967 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR47O94967 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR47O94967 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WDR47O94967 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR47O94967 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR47O94967 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR47O94967 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR47O94967 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR47O94967 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR47O94967 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR47O94967 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR47O94967 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WDR47O94967 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR47O94967 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
WDR47O94967 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms