Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOBOXO60393 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOBOXO60393 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NOBOXO60393 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOBOXO60393 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms