Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDIL3O43854 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDIL3O43854 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EDIL3O43854 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDIL3O43854 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms