Protein–RNA interactions for Protein: O43825

B3GALT2, Beta-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GALT2O43825 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
B3GALT2O43825 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B3GALT2O43825 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B3GALT2O43825 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
B3GALT2O43825 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B3GALT2O43825 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
B3GALT2O43825 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
B3GALT2O43825 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B3GALT2O43825 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
B3GALT2O43825 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B3GALT2O43825 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms