Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STX6O43752 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STX6O43752 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STX6O43752 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
STX6O43752 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STX6O43752 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STX6O43752 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
STX6O43752 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STX6O43752 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
STX6O43752 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STX6O43752 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STX6O43752 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STX6O43752 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
STX6O43752 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
STX6O43752 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
STX6O43752 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
STX6O43752 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
STX6O43752 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STX6O43752 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STX6O43752 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STX6O43752 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STX6O43752 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STX6O43752 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STX6O43752 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STX6O43752 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STX6O43752 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STX6O43752 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STX6O43752 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STX6O43752 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STX6O43752 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STX6O43752 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STX6O43752 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STX6O43752 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
STX6O43752 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STX6O43752 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STX6O43752 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STX6O43752 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STX6O43752 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STX6O43752 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STX6O43752 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STX6O43752 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
STX6O43752 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STX6O43752 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STX6O43752 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STX6O43752 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STX6O43752 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STX6O43752 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STX6O43752 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STX6O43752 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
STX6O43752 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STX6O43752 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STX6O43752 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STX6O43752 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STX6O43752 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STX6O43752 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STX6O43752 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STX6O43752 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STX6O43752 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STX6O43752 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STX6O43752 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
STX6O43752 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STX6O43752 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STX6O43752 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STX6O43752 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STX6O43752 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STX6O43752 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STX6O43752 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
STX6O43752 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
STX6O43752 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
STX6O43752 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STX6O43752 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STX6O43752 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
STX6O43752 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STX6O43752 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STX6O43752 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
STX6O43752 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STX6O43752 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STX6O43752 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STX6O43752 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STX6O43752 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STX6O43752 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STX6O43752 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
STX6O43752 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STX6O43752 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STX6O43752 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STX6O43752 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STX6O43752 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STX6O43752 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STX6O43752 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STX6O43752 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STX6O43752 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STX6O43752 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STX6O43752 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STX6O43752 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STX6O43752 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STX6O43752 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STX6O43752 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STX6O43752 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STX6O43752 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STX6O43752 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms