Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SPRY3O43610 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPRY3O43610 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPRY3O43610 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY3O43610 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY3O43610 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY3O43610 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY3O43610 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRY3O43610 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRY3O43610 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRY3O43610 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRY3O43610 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRY3O43610 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRY3O43610 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPRY3O43610 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRY3O43610 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRY3O43610 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRY3O43610 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRY3O43610 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRY3O43610 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRY3O43610 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRY3O43610 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRY3O43610 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRY3O43610 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPRY3O43610 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY3O43610 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY3O43610 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY3O43610 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY3O43610 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPRY3O43610 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY3O43610 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY3O43610 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY3O43610 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRY3O43610 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRY3O43610 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRY3O43610 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRY3O43610 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRY3O43610 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRY3O43610 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms