Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PODXLO00592 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PODXLO00592 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PODXLO00592 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PODXLO00592 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PODXLO00592 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PODXLO00592 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PODXLO00592 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PODXLO00592 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PODXLO00592 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PODXLO00592 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PODXLO00592 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PODXLO00592 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXLO00592 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXLO00592 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXLO00592 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PODXLO00592 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PODXLO00592 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PODXLO00592 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PODXLO00592 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PODXLO00592 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PODXLO00592 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PODXLO00592 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PODXLO00592 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXLO00592 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXLO00592 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXLO00592 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXLO00592 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PODXLO00592 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PODXLO00592 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PODXLO00592 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PODXLO00592 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PODXLO00592 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PODXLO00592 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PODXLO00592 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PODXLO00592 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PODXLO00592 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PODXLO00592 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PODXLO00592 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PODXLO00592 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PODXLO00592 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PODXLO00592 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PODXLO00592 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PODXLO00592 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PODXLO00592 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXLO00592 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXLO00592 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXLO00592 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXLO00592 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PODXLO00592 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PODXLO00592 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PODXLO00592 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PODXLO00592 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PODXLO00592 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PODXLO00592 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PODXLO00592 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PODXLO00592 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PODXLO00592 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PODXLO00592 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PODXLO00592 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PODXLO00592 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PODXLO00592 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PODXLO00592 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PODXLO00592 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PODXLO00592 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PODXLO00592 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PODXLO00592 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PODXLO00592 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PODXLO00592 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PODXLO00592 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PODXLO00592 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PODXLO00592 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PODXLO00592 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PODXLO00592 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PODXLO00592 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PODXLO00592 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PODXLO00592 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PODXLO00592 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PODXLO00592 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PODXLO00592 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PODXLO00592 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PODXLO00592 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PODXLO00592 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PODXLO00592 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PODXLO00592 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PODXLO00592 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PODXLO00592 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PODXLO00592 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PODXLO00592 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PODXLO00592 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PODXLO00592 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PODXLO00592 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PODXLO00592 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PODXLO00592 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PODXLO00592 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PODXLO00592 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PODXLO00592 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PODXLO00592 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PODXLO00592 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PODXLO00592 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms