Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRBOX1C9JBD0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRBOX1C9JBD0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRBOX1C9JBD0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRBOX1C9JBD0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRBOX1C9JBD0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRBOX1C9JBD0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRBOX1C9JBD0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRBOX1C9JBD0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRBOX1C9JBD0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRBOX1C9JBD0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRBOX1C9JBD0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRBOX1C9JBD0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms