Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WIPF3A6NGB9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WIPF3A6NGB9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WIPF3A6NGB9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms