Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP5LA4QPB2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP5LA4QPB2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP5LA4QPB2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRP5LA4QPB2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP5LA4QPB2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP5LA4QPB2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP5LA4QPB2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRP5LA4QPB2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP5LA4QPB2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP5LA4QPB2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP5LA4QPB2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRP5LA4QPB2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP5LA4QPB2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRP5LA4QPB2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms