Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAMTA1Q9Y6Y1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMTA1Q9Y6Y1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms