Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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