Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PAXBP1Q9Y5B6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms