Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms