Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POMPQ9Y244 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms