Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED23Q9ULK4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms