Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NRXN1Q9ULB1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms