Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACFD1Q9UGQ2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms