Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN8Q9UBY8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms