Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNAL1Q9UBT7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms