Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DPM3Q9P2X0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DPM3Q9P2X0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms