Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms