Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
BICRAQ9NZM4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BICRAQ9NZM4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms