Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms