Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms