Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms