Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUFT1Q9NNX1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms