Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM27Q9HBJ8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms