Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EXO5Q9H790 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms