Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB1BQ9H0U4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms