Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NYXQ9GZU5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NYXQ9GZU5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms