Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CIPCQ9C0C6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CIPCQ9C0C6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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