Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP4Q9C0A0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTNAP4Q9C0A0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms