Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRCC1Q9C099 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRCC1Q9C099 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms