Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PUS3Q9BZE2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PUS3Q9BZE2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms