Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP4AQ9BY43 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4AQ9BY43 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms