Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC4A5Q9BY07 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms