Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms