Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB11FIP5Q9BXF6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB11FIP5Q9BXF6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms