Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBM4Q9BWF3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms