Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms