Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FYCO1Q9BQS8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FYCO1Q9BQS8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms