Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USB1Q9BQ65 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USB1Q9BQ65 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms