Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms