Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD5Q99666 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD5Q99666 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms